飛秒激光的另一個有希望的應用是通過恢復晶狀體的柔韌性來扭轉老花眼。希望飛秒激光可用於在晶狀體內部創建微切口，而無需手術睜開眼睛（圖2）。這些微通道可以減少作為滑動平面的晶狀體組織的內部摩擦。這些激光切口在送入兔眼時不會引起白內障生長或傷口癒合異常。當應用於人的屍檢眼時，前後晶狀體厚度平均增加了100μm，相當於調節幅度增加了2.00至3.00 D（圖3）。
如果飛秒激光的強度保持在剛好低於光學擊穿閾值，則有可能產生低密度等離子體，這將使自由電子與周圍組織相互作用。這些化學反應可能會導致光學介質的折射率發生輕微變化，這種現象可用於將衍射透鏡編程到角膜或晶狀體中。在動物研究中，折射率整形已顯示可穩定數週或數月。16該原理也可用於原位調整IOL的功能。
使用雙光子吸收可能會向角膜後或鞏膜組織施加超短激光脈衝。因此，外科醫生可以將CXL應用於眼睛的較深區域，近視雷射以對圓錐角膜患者產生進一步的有益效果。光漂白或使用多光子吸收來化學化學破壞原子核內的吸收，熒光和散射蛋白聚集體，可以消除晶狀體的泛黃。在一個實驗中，使用800納米紅外飛秒脈衝激光對18個人類供體晶狀體進行了處理。治療後，研究人員發現，與年齡有關的晶狀體黃變減少，光的透射率增加。最後，使用相干控制（一種基於量子力學的方法來控制動態光過程），可以有選擇地漂白晶狀體。